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El presente manual describe las enfermedades de plantas tropicales a partir de los síntomas asociados a diversos patógenos, así como la documentación detallada de la sintomatología y de la morfología de los hongos fitopatógenos, incluyendo estructuras como hifas, células conidiógenas, conidióforos y conidios. La necesidad de documentar los patógenos asociados a los síntomas observados en los cultivos surge del trabajo académico con estudiantes de agronomía. Al revisar la literatura y contrastarla con observaciones de campo y laboratorio, se detectó con frecuencia la presencia de hongos distintos a los previamente reportados para síntomas similares. Aunque muchos hongos pueden provocar manifestaciones sintomáticas semejantes, resulta relevante dar a conocer estos hallazgos como un primer acercamiento a posibles nuevos registros de hongos asociados a dichos síntomas en la región. No se pretende atribuir de manera definitiva la causalidad de las enfermedades descritas, ya que ello requiere la aplicación de los postulados de Koch y el uso de herramientas moleculares. Este documento tiene, por tanto, un enfoque didáctico y práctico, orientado al aprendizaje, diagnóstico preliminar y manejo fitosanitario por parte de estudiantes de agronomía y productores agrícolas. Los hongos fitopatógenos aquí documentados se encuentran asociados a 22 cultivos establecidos en La Ceiba, Honduras, y en Loma Bonita, Oaxaca, así como en sus zonas aledañas. Como resultado, se presenta un inventario de 19 géneros pertenecientes a los phyla Ascomycota y Basidiomycota, principalmente en su estado anamorfo, los cuales conforman el grupo más relevante de hongos patógenos en los sistemas de producción agrícolas, en algunos casos se repiten los géneros en diferentes cultivos. La transformación de ecosistemas naturales en agroecosistemas ha favorecido cambios en el comportamiento de diversos microorganismos; así, hongos que originalmente no causaban daño a las plantas pueden convertirse en patógenos potenciales bajo condiciones de manejo intensivo, especialmente en monocultivos extensivos.